Varios tamaños y resoluciones en un sólo Favicon

Lo que yo hago para guardar varias imágenes de distintos tamaños en un mismo archivo ICO es usar el programa Icofx, ( te lo puedes descargar desde http://icofx.ro ) este programa te permite añadir varias imágenes a un mismo archivo, con diferentes resoluciones y cantidad de colores.

Después el navegador es el que se encarga de escoger la imagen que necesita. En windows, por ejemplo, estos archivos se muestran diferente si eliges ver las carpetas como una lista o como iconos. Es windows el que escoge el tamaño de imagen segun la configuración que tu tengas.

En estos momentos ningun navegador utiliza una imagen mayor que 16x16 pero es bueno crear un favicon con varias resoluciones para poder ser utilizados en otras ocasiones, o para cuando los navegadores empiecen a utilizar resoluciones superiores.

Fuente: getfavicon.org